"По правильному", файлы нужно складывать либо в директорию files либо в директорию templates(если предполагается что это будет шаблон).
А обращаться к нему как то так.
file { '/etc/motd' :
ensure => present,
source => 'puppet:///files/motd.conf'
}
Директория files должна находиться на одном уровне с директориями manifests / modules / templates