Как избавиться от бэкслэша если за ним сразу нижнее подчёркивание?

Question

[wolverine777]

Привет, у меня есть такой вот скрипт

ls -ltr | awk '{print$9}' | sed 's/_R.*$//g' | uniq | head -9 | sed -n '1!p' > list

while read -r line

do
       echo $line\_R2-paired.fastq.gz
       echo "%%%%%%%%%%%%%%%%"
               echo " hisat2 -p 8 --dta -q --phred33 -x /scratch/saragood/dimitri/L002_zipped/imam002_hisat_repo/imam002 \
                        -1 /scratch/saragood/dimitri/L002_zipped/paired/$line\_R2-paired.fastq.gz \
                        -2 /scratch/saragood/dimitri/L002_zipped/paired/$line\_R1-paired.fastq.gz \
                        -S /scratch/saragood/dimitri/L002_zipped/sams/$line.sam"
done < list

rm list

и мне хочется чтобы при его запуске выходило такое:

-1 /scratch/saragood/dimitri/L002_zipped/paired/RNA-CCC_8T1_S6_L002_R2-paired.fastq.gz

а из-за бэкслэша после $line получается такое:

-1 /scratch/saragood/dimitri/L002_zipped/paired/RNA-CCC_8T1_S6_L002\_R2-paired.fastq.gz

Подскажите пожалуйста как убрать этот ненужный мне бэкслэш? Если его просто убрать то получается

-1 /scratch/saragood/dimitri/L002_zipped/paired/-paired.fastq.gz

Спасибо!

Answer 1

[Adamos]

Попробуй заменить все $line\ на ${line}

Comments

[wolverine777]

Спасибо!

[Karpion]

Вообще, чтобы брать значение переменных окружения, их лучше не раздумывая брать в фиг.скобки. Примерно по той же причине, по какой регекс-шаблоны берут в апострофы.

И кстати, хорошо бы писать не ${line}, а "${line}" - на случай наличия в переменной line пробелов и прочих спец.символов.

[Adamos]

Karpion, уточню: в кавычки стоит брать не переменную посреди выражения, а все выражение, в котором она встречается, если оно должно быть единым аргументом.

[Karpion]

Adamos, Ну, можно так:

"/scratch/saragood/dimitri/L002_zipped/paired/${line}_R2-paired.fastq.gz"

т.е. в кавычках - весь аргумент. Тут без разницы. Но брать в кавычки больше - уже нельзя, там пробелы-разделители аргументов.

А можно брать меньше, вот примеры (надеюсь, я ничего не напутал):

/scratch/saragood/dimitri/L002_zipped/paired/"${line}"_R2-paired.fastq.gz
/scratch/saragood/dimitri/L002_zipped/paired/"${line}_R2-paired".fastq.gz
/scratch/saragood/dimitri"/L002_zipped/paired/${line}"_R2-paired.fastq.gz

Поэкспериментируйте с командой echo, давая ей такие аргументы.

[Adamos]

Karpion, да понятно, что баш с этим разберется. Читающий запутается ;)

[Karpion]

Adamos, Возможно, wolverine777 окажется в роли читающего - так что пусть знает, как можно.
А кавычки вокруг ${line} - надо ставить. Во избежание.