Здравствуйте.
Для решения проблемы нажмите CTRL+SHIFT+P и введите "Install".
Первым пунктом выйдет строка "Package Control: Install Package". Нажмите Enter.
Перед вами откроется стандартное окно Пакетного установщика, который вы и пытались вызвать.
При последующих попытках запуска вашим способом все должно работать правильно. По крайней мере, у меня такой метод сработал.