Здравствуйте. Можете поискать плагин jl no doubles.
По сути о старых ссылках будете знать только вы, Joomla будет собирать все страницы с www и без него и такие страницы буду тоже дублями.
Для начала сделайте правки в файле .htaccess
Для этого в интернете наберите - как убрать дубли страниц с www на сайте Joomla.