Через http_build_query, никак, формируйте самостоятельно через цикл, или вручную
$query = urlencode('code[]') . '=' . urlencode(100) . '&' . urlencode('code[]') . '=' . urlencode(200);
Цифры я поставил в urlencode просто для того чтобы были, и на всякий случай если вместо них будут другие данные, чтобы не забыть.