Делайте в разных.
"Изменили поле и, не дожидаясь фронтенщика лезу сам и правлю это поле не дожидаясь его. "
У вас фронтенд и бэкенд в одном файле? В одной папке?
Если нет, то какая разница зайти в соседнюю папку или зайти в другой репозиторий в соседней папке?
Зато логи коммитов не будут путаться. И когда все устаканится тоже будет проще - не нужно ничего разносить.
Как вы выстраиваете работу в команде из 2-х и более человек?
Для 2х человек вообще неважно. Двум договориться проще. Но в будущем, если предполагается что все будет разноситься, то почему не сделать это сейчас?
Или берете через месяц еще одного фронтендера и начинаете ему рассказывать где фронт, где бэк и чем оно собирается, выдаете доступы на все, и говорите куда не лезть. А если фронт и бэк сразу в разных, то не нужно ничего этого делать.
Вдобавок прямо сейчас лог коммита не будет засран ненужными вещами, которые важны только одному из вас.