Проблема в том, что если не сконфигурировать диски в виртуальные на RAID-контроллере, то Debian при установке их просто не видит. Это такая фича, так и должно быть, или я делаю что-то неправильно?
При наличии аппаратного контроллера ОС видит только те LUN, которые ей отдаёт контроллер. Про то какие физические диски есть под контроллером она знать не знает.
Ноль информации, хотя бы какой контроллер, какая материнская плата и т.п.
Проблема не в linux а в этом контроллере (или в наличии драйверов к контроллеру).
Если проблема в том, что у вас имеется лишь один диск и аппаратный контроллер, то сделайте из этого диска RAID-0.
Обычно в таких ситуациях так и делают.