Это место резервируется для потребностей VIP-персон - программ, работающих с правами суперпользователя. Это довольно разумное решение, т.к. им часто нужно срочно записать что-то важное.
Кроме того, при заполнении диска эффективность его работы падает.
На HDD - из-за фрагментации файлов.
На SSD - фрагментация файлов не опасна; зато прошивка SSD начинает испытывать затрудения с ремапингом секторов, а это нужно для снижения износа flash-памяти.
Так что разработчики всё правильно сделали. На FreeBSD это давно практикуется.