Если Вам мешает это предупреждение:
1) Открываем
~/.bash_profile
2) Добавляем туда
export BASH_SILENCE_DEPRECATION_WARNING=1
3) Сохраняем изменения
и почему не сохраняются изображения в приложении gimp? (Судя по всему это связано)
Никак не связано. Это просто warning.