Нужно с помощью библиотеки открыть файл и записать его заново. При записи пропусти первые 5 строк. Только не ошибись с первой строкой. Это заголовок, его нужно записать.
book = xlwt.Workbook()
# Add a sheet to the workbook
sheet1 = book.add_sheet("Sheet1")
# The data
cols = ["A", "B", "C", "D", "E"]
txt = [0,1,2,3,4]
# Loop over the rows and columns and fill in the values
for num in range(5):
row = sheet1.row(num)
for index, col in enumerate(cols):
value = txt[index] + num
row.write(index, value)
# Save the result
book.save("test.xls")