Вариантов много. Можно не кешировать шаблон, а только скрипт php - при этом вынеся выборку файлов за область кеша, можно вынести выборку файлов для элемента выше по коду и использовать результат для определения ключа кеша, наконец можно использовать
component_epilog.
В итоге как верно отметил предудыщий оратор, выбор решения должен основываться на специфике проекта и конкретной задачи.