Нужно копировать шаблон компонента в свой шблон сайта (пространство имен, как называют битриксойды). Смотреть, как там все сделано и при определенном навыке почти все удлаять, оставлять только коркас и что нужно именно вам, чтобы просто не повторять код. так же все подшаблоны и лишние файлы удалять.
Если что-то понадобится то лучше посмотреть, как сделано в типовом и перенести себе, чем изначально все оставлять. Просто будите путаться в коде.
Битриксе сложнаая структура, по этому чем меньше файлов вы будите оставлять, тем легче потом будет ориентироваться в ней.
