если про однострочник включения/выключения, то так.
# sed 's/test/another test' ./myfile
т.е. один скрипт выключения команды - вставляем #
# sed 's/<команда>/#<команда>' /etc/crontab
и еще один скрипт включения команды - удаляем #
# sed 's/#<команда>/<команда>' /etc/crontab
вариант2: воспользоваться /etc/cron.d если твой крон такое умеет.
создаешь в нем файлик с необходимыми строчками.
для выключения мувишь его в какую-нить директорию, для включения мувишь обратно в /etc/cron.d