Там действительно немного запутано, но в целом все просто. Вы платите за каждую зону, которую хотите по 0.5$ в месяц, за все обращения к dns сервису по вашим зонам и за health checks, находящиеся не в вашем AWS аккаунте. Если я где-то не так сказал - пусть меня поправят. Там есть ещё traffic flow, но не уверен что он вам нужен. Разумеется траффик до сервисов как Elastic load balancer, CloudFront и S3 бесплатен
По другим сервисам не скажу.
дока есть и на русском, между прочим