в общем случае default vlan - это тот vlan, который присутствует на устройстве из коробки; тот vlan, который будет на порту коммутатора, если администратором не предпринимались действия по смене номера vlan.
если у порта, к которому подключен роутер, один номер vlan на коммутаторе, а у порта, к которому подключено устройство - другой номер vlan, то через этот коммутатор роутер и устройство видеть друг друга не будут.
вы бы написали, для чего вам потребовались манипуляции с vlan'ами, может, кто своё мнение и выскажет. а если так, "убираю порт из vlan и перестаёт видеть всё" - результат вполне ожидаемый и корректный.