Вы как-то неоднозначно сформулировали признак похожести, но это не беда. Ошибка в том, что в цикле
for k in ... в
k будет значение элемента, а не его индекс. Если нужно сравнивать 2 списка поэлементно, используйте zip:
for a, b in zip(list_a, list_b):
...
Если промежуточные результаты не важны, а нужен ответ по всему набору, я бы сделал примерно так:
lst_a = [0.1, 0,1, 0.99, 0.1, 0.99]
lst_b = [0.32, 0.04, 0.98, 0.36, 0.95]
compare_func = lambda a, b: b > 0.9 and a == 0.99
is_similar = all(compare_func(a, b) for a, b in zip(lst_a, lst_b))
compare_func, очевидно, неправильная, но тут уж проблем быть не должно.