Независимо от среды разработки можно действовать следующим образом.
1. Создаете пустой репозиторий на GitHub или любом другом серверном Git. Это будет удаленная копия вашего репозитория.
2. Создаете в своей любимой среде разработки новый проект.
3. С помощью консольного или графического клиента Git создаете в папке нового проекта репозиторий Git.
cd [Папка проекта]
git init
4. Делаете первый коммит, например с файлом .gitignore.
5. Настраиваете ссылку на удаленный репозиторий в локальном репозитории, созданном в 3
git remote add origin [URL удаленного репозитория]
origin - имя ссылки на удаленный репозиторий
5. Отправляете изменения во внешний репозиторий
git push origin master
здесь мы говорим отправить на удаленный репозиторий с именем origin ветку master из локального репозитория.
6. Далее пользуетесь любым клиентом для работы с локальным репозиторием, включая встроенный в IDE.