Рекомендую вам все таки озаботиться изучением такой вещи как ACL(
help.ubuntu.ru/wiki/access_control_list), а не давать FTP пользователю Рут права. Если это ваша личная локальная машинка, которая и в интернет то не смотрит, то проблем нет, если же это сервер с доступом к сети то вам по рукам настучат за подобное. Непосредственно судо права кроме как администратору не нужны, и уж тем более не нужны для ФТП.
И да, вы удивитесь, но через SFTP вполне комфортно работается даже с огромным количеством файлов.
И поправить через консоль, поверьте, подчас намного быстрее, чем загружать файл, править его и выгружать обратно