Создайте такой код и через консоль запустите.
while(true) {
// какой то код
sleep(5);
}
Но тут есть два известных мне нюанса - как только вы закроете консоль, скрипт прекратит работу (решается использованием так называемого скрина screen). И второй - на сервере может быть временной лимит на выполнение скриптов. На шаред хостингах он обычно не превышает 120 секунд.
И еще один момент - если скрипт не оптимизирован, он будет поджирать память, пока она не кончится и ОС его не грохнет.
Либо как вариант можете использовать PM2 для NodeJS - там можно в фоне держать процессы, не нужен крон и бд, но нужен NodeJS.