Добрый день, помню в gulp'e можно было настроить что бы если ты в проект используешь jquery+ lib1+ lib2 + app.js в конце получаешься один файл. Есть ли такие онлайн сервисы, дабы сжать все файлы в один)
Берёшь gulp-rigger помещаешь пути всех файлов-библиотек в один, далее скармливаешь его в gulp-rigger и радуешься жизни, дополнительно можно прогнать ещё через gulp-uglify
Для gulp есть webpack. Посмотри gulp-webpack-stream кажется называется. Webpack специально заточен под то что ты описываешь. Там просто прописывается один таск и все ок.