После инициализации гита, делаете первый комит (обычно в нем гитигнор, ридми, по мелочам может быть что то)...
Добавляете(локально) в индекс гита нужные папки/файлы: git add /folder/file.php или git add /your_project_folder/
После комитите: git commit -m'Upload my project to github or etc'
И пушите: git push origin master
// Перед комитом, можно посмотреть какие файлы были добавлены в индекс git status
пароль и логин все равно запрашивает при пуше.
значит вы добавили вот так:
git remote add origin
https://...
удалите локально ремоут и добавьте вот так:
git remote add origin
git@....