Как делать 3d-реализации построения данных в Python?

Question

[Олег Петров]

Есть функция нахождения экстремума в реалтайм, например от 2 или более параметров.
Посоветуйте пожалуйста пример как красиво реализовать 3d-визуализацию.
Наподобие такого, только можно еще круче.


Хотелось бы строился график в реалтайме.
Может быть знаете где найти туториал или урок как сделать?
P.S. Ответ найден.
https://matplotlib.org/gallery/animation/simple_3d...
Plot.ly красивее выглядит, но я так и не понял как с ним работать оффлайн не в окошке html, через IDE без браузера. Кто подскажет, тому благодарность.
P.P.S.
Нашел библиотеку. Просто бомба для тех, кто строит 3d Real-time графики. Не забудьте сказать спасибо.
vispy.org/installation.html

Comments

[Руслан Гильфанов]

Кажется вот эта библиотека https://plot.ly/python/ позволяет визуализировать статистические данные как с 2D, так и 3D анимацией.

[Олег Петров]

Руслан Гильфанов, Вот теперь вопрос. Например есть у нас такой прекрасный график.
https://plot.ly/python/3d-surface-plots/
Как сделать , чтобы данные обновлялись автоматически?
Просто Берем csv.файл и исходными данными и записываем в него строки, и график получается должен обновляться сам?

[Олег Петров]

Руслан Гильфанов, Графики красивые.

[Олег Петров]

Олег Петров, И там еще регистрироваться нужно, чтоб график построить. =(

[Руслан Гильфанов]

Олег Петров, я сам ещё не пользоваться. Скинул ссылку на первое, что нашёл)

[Руслан Гильфанов]

Олег Петров, а чтобы график построить -- можно вроде и себе библиотеку скачать.

[Олег Петров]

Пробую такой, но ничего не выходит.

import plotly.plotly as py
import plotly.graph_objs as go
import pandas as pd




# Read data from a csv
z_data = pd.read_csv('https://raw.githubusercontent.com/plotly/datasets/master/api_docs/mt_bruno_elevation.csv')

data = [
    go.Surface(
        z=z_data.as_matrix()
    )
]
layout = go.Layout(
    title='Mt Bruno Elevation',
    autosize=False,
    width=500,
    height=500,
    margin=dict(
        l=65,
        r=50,
        b=65,
        t=90
    )
)
fig = go.Figure(data=data, layout=layout)
py.iplot(fig, filename='elevations-3d-surface')

[javedimka]

Олег Петров, у plot.ly есть подробное описание о том как строить графики и как строить их в оффлайн режиме на python

[Владимир Олохтонов]

Если решили делать на matplotlib, то напишите в начале import seaborn, графики сразу похорошеют :)

[Олег Петров]

javedimka, я прочитал, но в описании указано , что они строятся или в окне браузера или Jupiter notebook ,и то и то неудобно, так как я хочу сделать 3D-визуализацию реалтайм получаемых данных в pycharm.

[Олег Петров]

Владимир Олохтонов, спасибо , попробую. А как так происходит ?

[Владимир Олохтонов]

Олег Петров, насколько я понимаю, там при импорте заменяется часть переменных ответственных за отображение.

[Олег Петров]

Владимир Олохтонов, Тренируюсь на такой 3d анимации.
Графики такие же что с Import seaborn, что без этой строки.
Import seaborn - выделено серым, это значит что библиотека не используется.
Что я делаю не так?

import seaborn
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import mpl_toolkits.mplot3d.axes3d as p3
import matplotlib.animation as animation

# Fixing random state for reproducibility
np.random.seed(19680801)


def Gen_RandLine(length, dims=2):
    """
    Create a line using a random walk algorithm

    length is the number of points for the line.
    dims is the number of dimensions the line has.
    """
    lineData = np.empty((dims, length))
    lineData[:, 0] = np.random.rand(dims)
    for index in range(1, length):
        # scaling the random numbers by 0.1 so
        # movement is small compared to position.
        # subtraction by 0.5 is to change the range to [-0.5, 0.5]
        # to allow a line to move backwards.
        step = ((np.random.rand(dims) - 0.5) * 0.1)
        lineData[:, index] = lineData[:, index - 1] + step

    return lineData


def update_lines(num, dataLines, lines):
    for line, data in zip(lines, dataLines):
        # NOTE: there is no .set_data() for 3 dim data...
        line.set_data(data[0:2, :num])
        line.set_3d_properties(data[2, :num])
    return lines

# Attaching 3D axis to the figure
fig = plt.figure()
ax = p3.Axes3D(fig)

# Fifty lines of random 3-D lines
data = [Gen_RandLine(25, 3) for index in range(50)]

# Creating fifty line objects.
# NOTE: Can't pass empty arrays into 3d version of plot()
lines = [ax.plot(dat[0, 0:1], dat[1, 0:1], dat[2, 0:1])[0] for dat in data]

# Setting the axes properties
ax.set_xlim3d([0.0, 1.0])
ax.set_xlabel('X')

ax.set_ylim3d([0.0, 1.0])
ax.set_ylabel('Y')

ax.set_zlim3d([0.0, 1.0])
ax.set_zlabel('Z')

ax.set_title('3D Test')

# Creating the Animation object
line_ani = animation.FuncAnimation(fig, update_lines, 25, fargs=(data, lines),
                                   interval=50, blit=False)

plt.show()

[Олег Петров]

Владимир Олохтонов, Также и 3d-поверхность.
Ничего не хорошеет и import seaborn просто не используется.

import seaborn
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib import cm
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D

X = np.arange(-5, 5, 0.25)
Y = np.arange(-5, 5, 0.25)
X, Y = np.meshgrid(X, Y)
R = np.sqrt(X**2 + Y**2)
Z = np.sin(R)

fig = plt.figure()
ax = Axes3D(fig)
ax.plot_surface(X, Y, Z, rstride=1, cstride=1, cmap=cm.viridis)

plt.show()

[Владимир Олохтонов]

Олег Петров, Ваш первый код вывел только пустые координаты, второй вот такую картинку:


Это в jupyter-notebook.

[Олег Петров]

Владимир Олохтонов, да у меня такая же получилась , но без seaborn.

Answer 1

[longclaps]

тыц

Comments

[Олег Петров]

Спасибо , а если данные будут постоянно подгружаться, то график будет обновляться ?

[Олег Петров]

Я просто реализовал генетический поиск минимума с записью значений в банк данных и было бы интересно наблюдать в реал-тайм за процессом поиска , как в видео на Ютубе.

[Олег Петров]

Попробовал сделать через цикл с небольшим шагом изменения параметра графика, но он обновляется, только после того я закрою предыдущий?
Как я понимаю динамический график нельзя сделать с помощью данного метода?

[longclaps]

Олег Петров, поищи - там есть анимация

[Олег Петров]

longclaps, Наконец-то нашел,Спасибо.
https://matplotlib.org/gallery/animation/simple_3d...