На флешке с файлами был вирус, удалил через nod32, теперь на флешке не видно файлов, хотя занята он на 40%.
Включал опцию показа скрытых файлов - не помогло.
Что делать?
Как бы они ни прятались, их всегда можно вытащить на свет с помощью утилит типа R-Studio, Recuva или аналогичных. Если, конечно, поверх них не было записано что-то ещё.