Думаю, да.
Сначала в конфиге MySQL установите:
general_log_file = /var/log/mysql/general.log
А затем перед нужным запросом попытайтесь включить: SET GLOBAL general_log = 'ON';, а после - SET GLOBAL general_log = 'OFF';
Скорее всего, в это время будут цепляться и другие, ненужные запросы, но так хотя бы размеров логов будет не таким большим