Договор, предметом которого является выполнение комплекса работ по разработке интернет-сайта, необходимо квалифицировать как договор авторского заказа (п. 1 ст. 1288 Гражданского кодекса РФ). В случае если договор авторского заказа предусматривает отчуждение заказчику исключительного права на произведение, которое должно быть создано автором, то к такому договору применяются правила ГК РФ о договоре об отчуждении исключительного права, если из существа договора не вытекает иное (п. 3 ст. 1288 ГК РФ).
С технической точки зрения интернет-сайт представляет собой комплекс, состоящий из программы для ЭВМ, которая обеспечивает непосредственно работу сайта, и базы данных, которая представляет собой наполнение сайта, его содержание.
Местом выполнения работ по разработке программ для ЭВМ и баз данных, их адаптации и модификации признается РФ, в случае если покупатель осуществляет свою деятельность на территории РФ (абз. 4 пп. 4 п. 1 ст. 148 Налогового кодекса РФ).
Следовательно, в данном случае работы по разработке интернет-сайта облагаются НДС (пп. 1 п. 1 ст. 146 НК РФ).
В случае реализации работ (услуг), местом реализации которых является территория Российской Федерации, налогоплательщиками - иностранными лицами, не состоящими на учете в налоговых органах РФ, уплата налога осуществляется налоговыми агентами одновременно с перечислением денежных средств таким налогоплательщикам (абз. 2 п. 4 ст. 174 НК РФ).
Иностранные организации признаются плательщиками налога на прибыль в РФ в отношении доходов, получаемых от источников в РФ, определяемых в соответствии с положениями ст. 309 НК РФ. Доходы, полученные иностранной организацией от предоставления прав использования объектов интеллектуальной собственности, не связанные с ее предпринимательской деятельностью в РФ, относятся к доходам иностранной организации от источников в РФ и подлежат обложению налогом по ставке 20%.