подмонтировать доп.раздел как локальную папку, намухлевать симлинков/хардлинков, как уже подсказали.
собрать несколько файловых систем в одну большую через aufs.
много чего можно намудрить.
какой тип у архива ??
какие разделы, диски, место на файловых системах доступны тебе ??
Давным-давно, когда винты были маленькие, приходилось сталкиваться с чем-то подобным. был архив зип с кучей документации. распаковывал его по частям.
т.е. выделял часть фалов/диров чтобы аккурат влезло в свободное место, распаковывал их.
Потом разпакованное внутри зип-архива удалял - его размер уменьшался.
и снова часть фалов распаковывал и т.д. все получилось.