Для примера: на хостинге создали сайт: site.ru и его поддомен: demo.site.ru. На сайте site.ru настроили мультисайт. Там добавляем demo.site.ru, но при входе в консоль через админку выдается 404 ошибка. Она исправилась только после того, как закинули все файлы с site.ru на demo.site.ru.