Разбить в массив по точке-с-запятой. Затем каждый элемент разбить по запятой-с-пробелом в массив пар координат (они будут текстовыми строками "55.759906" и прогнать каждую через
parseFloat
чтобы стали числами:
var coords = "55.759906, 37.622242;50.455898, 30.521481";
coords = coords.split(';').map( e => e.split(', ').map(parseFloat));
//[[55.759906,37.622242],[50.455898,30.521481]]
// или вариант для старых браузеров:
coords = coords.split(';').map( function(e){ return e.split(', ').map(parseFloat)});