Насколько знаю Chrome и Firefox - нет, нельзя, они вообще ставят цель быть "ОС в ОС", поэтому внешнее API почти что отсутствует, зато есть возможности создания расширения и плагинов, которые можно так или иначе активировать из самого браузера, а если извне, то уже надо писать приложение для "основной" ОС, и как-то строить "мост".
Если смотреть Node.js, то уж лучше не он, а "чистый" V8, я его смотрел, там есть именно CLI, как у Python и т.п., права администратора ему требовать незачем.
Еще интерпретатор JScript встроен в Windows, но если JScript - это JS, то IE - это браузер. :)