Все зависит от частоты их отправки. Точно это сказать нельзя, но, допустим, если в среднем нужно отправлять больше одного сообщения в секунду, то лучше использовать WebSocket, но в то же время в таких приложениях как Trello значительно реже идет обмен сообщениями и постоянно держится веб-сокет соединение.