http://site.ru/id123456
add_action('init', 'do_rewrite');
function do_rewrite(){
add_rewrite_rule('^id([^/]*)?$','index.php?pagename=user&id=$matches[1]','top');
http://site.ru/123456
http://site.ru/username
http://site.ru/pupkin
http://site.ru/vasya