серверной части сервера
страшно звучит. Вы подразумевали какой-то распределенный сервер, где его части общаются между собой по модели клиент-сервер? Всё ещё страшно звучит. Ну да ладно.
Если по производительности, то Java скорее всего выйграет php и python. Скриптовые языки менее производительны компилируемых. Вообще выбирать php и python для написания сервера - плохая идея, они не для того и тут себя не раскроют и не окупят. Если хотите написать производительный сервер, то вам в C++, Golang, Rust, хотя и Java сойдет. У этих языков даже все инструменты для этого есть и библиотеки. Много серверов на них уже написано.