Я так понял, Вы хотите, чтобы Ваше ОДНО приложение крутилось на ТРЕХ инстансах томката, правильно?
По поводу установки, советую Вам просто распаковать архив с томкатом в разные папки.
По поводу кластеризации, томкат предоставляет такую возможность из коробки, читаете доки.
Вот тут есть пошаговая инструкция организации кластера с балансировкой нагрузки и репликацией сессий.