1. Найти окно по его классу.
2. Найти окно по процессу.
3. Передать название окна из второго приложения в первое любым удобным способом (файл, пайп, сокет, etc.)
Дополню, что для того чтобы найти окно по его классу надо использовать WinApi функцию FindWindow.
Класс окна можно узнать с помощью приложения Spy++ (есть в visual studio)