Файлы framework-а надо вынести на два уровня выше, убрать из публичной папки. Там оставить только assets, images и другие публичные папки, которые сейчас вероятно в web. И лучше убрать web - это рудимент явно (поднять их содержимое на уровень выше).
в папках www/a и www/b создать разные index.php в которых прописать пути к framework. Либо к разным либо к 1, но разным его app, например к backend и frontend.