Колонка с номерами строк в Sublime Text 3 называется
gutter.
Заходите в файл своей цветовой схемы с расширением
.tmTheme. Если не знаете, как это сделать, см.
здесь в первых двух абзацах после
Простое решение. Далее где-нибудь в начале между
<array><dict><key>settings</key<dict>
и
</dict></dict>
находите 2 строчки (у Вас будет не
red), если их нет, вписываете самостоятельно:
<key>gutter</key>
<string>red</string>
Вместо
red подставляете цвет, какой Вам угодно. Лучше в
HEX, а не
X11 colors, поскольку в Sublime Text 3 могут некорректно отображаться как минимум цвета
aqua,
fuchsia и
lime.
Ждём, иногда требуется несколько минут, чтобы изменения вступили в силу. Бывает, помогает перезагрузка файлов или Sublime Text 3. Результат, когда, к примеру, задали цвет
darkslategray.
Спасибо.