Разве что по косвенным признакам, в phpinfo() посмотрите на путь до php.ini, может он имеет вид что то вроде
/etc/php5/fpm/php.ini
Или поиском поищите "fpm" или "php-fpm", "php-cgi" может найдете что-то что можно использовать для проверки.
*fpm – fastcgi
Ещё вот вспомнил: если php-fpm запущен то должен быть процесс, можно проверить через команду юникса
ps aux
В php это будет так:
echo shell_exec('ps aux');
Но это не сработает если запущен и php-cgi и php-fpm одновременно
Простой
