AdBlock просто анализирует код и вырезает кусочки, которые похожи на рекламу - по названиям классов и айдишек элементов, по названиям файлов, по url откуда тянется контент. Если это свои баннера, то исключите из названий все, что связано c рекламой и баннерами. В том числе, возможно, придется попилить руками этот плагин, так как он скорее всего прописывает свои классы и айди в стиле "ad-zone" и тд. В общем, смысл в том, чтобы сделать свои баннера непохожими на баннера на уровне кода. Тогда они и не будут вырезаться.