Такой баг бывает не только в Webstorm, а во всех продуктах Jetbrains :-(
По крайней мере Idea и PhpStorm добавил бы в этот список.
Всегда считал, что это связано с Punto switcher, но видимо нет.
Такое возможно если в вашей ОС настройка 'Переключение источника ввода' стоит в положении - использовать свой источник для каждого окна, поменяйте её на - 'Использовать один источник для всех окон' и всё должно заработать.