Да уж, советчики.
Лежать может где угодно. Самый простой способ найти, посмотреть в конфигах апача или нджинкса (в зависимости от того, что используется). Конфиги открываются текстовым редактором. В одном из двух мест, найдёшь.
апач лежит тут
/etc/apache2/
а нджинкс тут
/etc/nginx/
Смотришь конфиги, как увидишь упоминание домена, ищи строки с путями. Они и будут указывать туда где лежит сайт.