В моем случае, когда шифрование было средством больше защиты от дурака, дабы тот не мог просто прочитать файл, использовал XTEA от уникального идентификатора компьютера — номера жеткого диска, процессора и других характеристик, которые просто было вытянуть.
При этом источники данных в Win и Lin были разными.