если через mysql, то как то так, только обязательно проверяйте, что отдает такой запрос, так как я только набросал код.
delete from table i where (select count (id) from table o where i.id2=o.id2 and i.id3=o.id3)>1;
На будущее:
- именуйте имена столбцов понятно
- добавьте ключ на два поля уникальный.