Надо просто внести в КИС для дефрагментатора исключение — не проверять открываемы файлы — тогда самозащита антивируса не будет мешать дефрагментации? или сейфмоде проводить дефраг данной папки
Вы неправильно поняли проблему — автор жалуется, что сама база данных антивируса дико фрагментируется за один-два дня. Процесс дефрагментации тут не причем. Ни разу не видел (да и возможно ли это вообще) влияние наличия работающего антивируса/ов на процесс дефрагментции диска.