Товарищ
Nc_Soft дал вполне работоспособные команды, да собственно и ваша изначальная тоже.
UPD: по замечанию
Nc_Soft исправлено про треды (прочитал 0 как 1, бывает).
Отмечу, что -threads 0 стоит продублировать перед -i и после: положение опции играет роль: до -i - параметры для входа (как будет параллелиться декодировщик), после -i - параметры для выхода (как будет параллелиться кодировщик). Значение параметра - число тредов. 0 - будет выбрано оптимальное число (обычно по числу ядер с учётом гипертрединга), указывать больше чем есть - начнёте платить за переключения контекстов сильно много.
С параметрами кодека лучше изучить:
ffmpeg.org/ffmpeg-codecs.html#libx264_002c-libx264rgb и поиграться с нужными параметрами. Качество, как и цвет и вкус, параметр очень субъективный.
Ещё вариант ускорения (если процессор простаивает и упираешься в IO): как минимум результат писать на tmpfs, после чего помещать куда нужно. Ну или переместиться полностью на SSD.
ЗЫ интересно, кто меня в эксперты подписал?