1. Во-первых, то как управляются конфигурации с несколькими мониторами, зависит не от Ubuntu, Linux и т.д., а от того, какой менеджер рабочего стола (DE) вы используете в этом Linux.
2. Конфигурация с несколькими мониторами может быть настроена по-разному: дублирование мониторов, продолжение мониторов, то как продолжаются эти поля мониторов по координатам и т.д. - вы ведь не говорите как это у вас настроено?
3. Конфигурации с несколькими мониторами достаточно капризные ... в настройках их через GUI-аплеты, в некоторых DE их так и нельзя настроить в точности до желаемого уровня....
4. Кроме того, конфигурации мониторов часто настраиваются (лучше!) не родными аплетами, а программами от производителя видеоадаптера, например NVIDIA X Server Settings
5. Совершенно точно и во всех деталях конфигурацию можно настроить редактируя файл Xorg.conf (всё только там).
Только что поставил убунту.
6. Но судя по вот этому ... вряд ли вы осилите п.5 ... даже не буду этого советовать, можно сделать много хуже.
Простой
