id_rsa это то, что вы НИКОГДА и НИКОМУ не должны давать!
Вам нужен id_rsa.pub - публичная часть.
Публичные ключи на сервере ложатся в /root/.ssh/authorized_keys для root, по одному публичному ключу на строку.
Ch00ee: Да просто создаете authorized_keys, ложите туда публичные ключи и подключаетесь, ничем не отличается от обычного сервера. А вообще рекомендую baseimage взять на базе ubuntu - там из коробки всё запускается и работает.