Здравствуйте.
1. Чаще всего внутри темы есть механизм минимальной кастомизации количества новостей и т.д. А если интересует глубокое погружение в WP, то смотреть в файлы шаблона главной страницы: home.php или index.php. Очень рекомендую начать изучение тут:
https://codex.wordpress.org/%D0%98%D0%B5%D1%80%D0%...
и тут:
https://codex.wordpress.org/%D0%A6%D0%B8%D0%BA%D0%...
Эти ссылки напрямую отвечают на Ваш первый вопрос. Также сталкивался с шаблонами WP, где создатель был, судя по всему, очень творческой личностью и "раскидал" один файл-шаблона по 3-4 в разных папках. С таких тем лучше не начинать изучение, плохо проведете время.
2. Все зависит от Вашей темы и глубины кастомизации, в некоторых случаях лучше добавить пару строчек в style.css и не парится, а в некоторых, крайних: выдохнуть и переписать всю верстку.