Короче, решение найдено в следующем:
1) Пишем флешку с образом Rufus`ом (GTP UEFI), тогда есть возможность видеть все разделы без проблем;
2) Устанавливаем eOS рядом с Win (кому как удобнее, можно руками разметить, можно и в автоматическом режиме);
3) Перезагружаемся и грузимся снова с live usb, устанавливаем boot-repair
sudo add-apt-repository ppa:yannubuntu/boot-repair
sudo apt-get update
sudo apt-get install -y boot-repair && boot-repair
4) В boot-repair нажать Advanced, в 3-й вкладке поставить птичку на PURE, следовать указаниям boot-repair`а.