Полный текст командной строки запуска компилятора есть?
В простейшем случае это что-то похожее на
g++ $(CXXFLAGS) -o program$(EXE) main.cpp module1.cp module2.cpp
Но в вашем случае если проект собирается из нескольких файлов через IDE, это может оказаться какой-то более сложной проблемой, например ошибкой линкера в обработке имен функций/метдов, измененных
манглером