Насколько я помню у nagios'a из коробки есть проверка на изменения файлов, и он как мне кажется попроще забикса, но забикс более активно развивающийся проект, если смотреть на будущее, развивать мониторинг, рисовать графики, делать эскалацию и отслеживать SLA то лучше zabbix.